Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms