Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms