Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx8Q9QXV1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms