Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms