Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copg2Q9QXK3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms