Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Limd1Q9QXD8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms