Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Reg3dQ9QUS9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Reg3dQ9QUS9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Reg3dQ9QUS9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Reg3dQ9QUS9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms