Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl2Q9QUK0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms