Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms