Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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SrfQ9JM73 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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