Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp1Q9JLK7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms