Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nectin3Q9JLB9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nectin3Q9JLB9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nectin3Q9JLB9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nectin3Q9JLB9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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