Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CubnQ9JLB4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CubnQ9JLB4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CubnQ9JLB4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms