Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gde1Q9JL56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gde1Q9JL56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gde1Q9JL56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gde1Q9JL56 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms