Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AatfQ9JKX4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms