Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms