Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ybx3Q9JKB3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ybx3Q9JKB3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms