Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard6bQ9JK83 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms