Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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