Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2j1Q9JJZ4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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