Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms