Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efcc1Q9JJF6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efcc1Q9JJF6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms