Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr3bQ9JHJ5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms