Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms