Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms