Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms