Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Aff4Q9ESC8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Aff4Q9ESC8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Aff4Q9ESC8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Aff4Q9ESC8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Aff4Q9ESC8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aff4Q9ESC8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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