Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ms4a4bQ9ES61 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4bQ9ES61 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4bQ9ES61 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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