Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube3bQ9ES34 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms