Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms