Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hipk3Q9ERH7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hipk3Q9ERH7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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