Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lima1Q9ERG0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms