Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhojQ9ER71 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms