Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms