Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ndst3Q9EQH7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndst3Q9EQH7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndst3Q9EQH7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndst3Q9EQH7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndst3Q9EQH7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ndst3Q9EQH7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ndst3Q9EQH7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ndst3Q9EQH7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndst3Q9EQH7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndst3Q9EQH7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndst3Q9EQH7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms