Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnft1Q9DCN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms