Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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