Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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