Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms