Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms