Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms