Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift43Q9DA69 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms