Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms