Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smco2Q9DA21 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms