Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms