Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms