Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D9S1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D9S1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms