Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn34b2Q9D9N2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn34b2Q9D9N2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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