Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Bpifa3Q9D9J8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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