Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmco5aQ9D9D5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms